Na graničnim prelazima između Bosne i Hercegovine i Hrvatske, kao i između Srbije i Hrvatske zabilježene su duge kolone vozila i višesatna čekanja na prelazak granice. 

Tako teretna vozila na graničnom prelazu, između Bosne i Hercegovine i Hrvatske, Jasenovac - Donja Gradina čekaju čak četiri sata na ulazak, dok je zadržavanje na graničnom prelazu Slavonski Brod - Bosanski Brod sat vremena. 

I na graničnom prelazu, između Srbije i Hrvatske, Tovarnik - Šid višesatna su čekanja na prelazak granice. 

Čekanja na granicama između Bosne i Hercegovine i Hrvatske, odnosno između Srbije i Hrvatske, duža su s obzirom da je primjena novog, EES sistema, ulaska u Evropsku uniju produžena na šest sati u prijepodnevnim satima i isto toliko u poslijepodnevnim satima. 

Novi sistem ulaska/izlaska (Entry/Exit System - EES) Europske unije primjenjuje se na svim međunarodnim graničnim prijelazima, kao i na onim pograničnim prijelazima koji su temeljem Ugovora između Republike Hrvatske i Bosne i Hercegovine privremeno određeni za međunarodni promet. Njegovom primjenom automatski se bilježe lični podaci, podaci o putnim ispravama te datumi i vremena ulaska ili izlaska državljana trećih zemalja, kao i moguća odbijanja ulaska u Republiku Hrvatsku, odnosno schengenski prostor.

Prilikom prvog ulaska u Republiku Hrvatsku, odnosno u Europsku uniju, od državljana trećih zemalja prikupljat će se biometrijski podaci - otisci četiri prsta i fotografija lica - uz podatke iz putne isprave. Ti će se podaci pohraniti u sistem i koristiti prilikom svakog sljedećeg prelaska granice, dok će se pri idućim prelascima utvrđivanje dosjea obavljati usporedbom fotografije lica snimljene uživo s postojećim dosjeom u sistemu, što će povećati razinu sigurnosti.

Ovo naime, važi za državljane regije, prvenstveno građane Bosne i Hercegovine, Srbije, Crne Gore, Albanije, Sjeverne Makedonije i Kosova, te Ukrajine, Moldavije i Velike Britanije kada je u pitanju Evropa. 

Sistem se ne primjenjuje na državljane Europske unije, bez obzira na mjesto prebivališta. Hrvatski državljani, kao i ostali državljani država članica Europske unije, koji žive u susjednim zemljama ili bilo kojoj drugoj trećoj zemlji i dalje će prelaziti državnu granicu uz predočenje putne isprave ili lične karte, bez obveze davanja biometrijskih podataka u okviru ovog sistema.